# playlist (click the video's upper-left icon)
source: Лекториум 2013年7月16日
Биоинформатика - это быстро растущий раздел computer science, благодаря которому биология в 21 веке переходит из раздела наук о жизни в вычислительные науки. Биоинформатики исследуют специфические алгоритмы и методы анализа больших объёмов данных, работая преимущественно с геномными и белковыми последовательностями. Благодаря биоинформатике учёные смогли прочитать геном человека, создать искусственную бактерию и вылечить некоторые виды рака.
В курсе будут даны базовые определения из биоинформатики и молекулярной биологии, которые понадобятся для понимания дальнейшего материала. Будет дан широкий обзор разделов биоинформатики с упором на методы чтения генома, а также на алгоритмы сравнения строк и алгоритмы неточного поиска подпоследовательстей в больших текстах.
Для желающих глубже изучить материал будут даны алгоритмические задачи с автоматизированной проверкой.
Предварительных знаний в биологии и биоинформатике не требуется.
Предварительная программа:
Введение в молекулярную биологию и биотехнологии.
Расстояния между последовательностями, эволюционные расстояния, матрицы замен, глобальное и локальное выравнивание.
Расстояния между последовательностями, эффективные алгоритмы попарного выравнивания, множественное выравнивание и эвристики.
Алгоритмы поиска подстроки в тексте, суффиксное дерево и массив, построение сжатых индексов по геному, BWT.
Поиск подстроки с ошибками, эвристические подходы, BLAST.
Гены. Алгоритмы предсказывания генов, статистические подходы и подходы, основанные на сходстве.
Чтение и сборка геномов. Исправление ошибок в данных.
Сборка геномов, графовые алгоритмы в биоинформатике, графы де Брюйна.
Вычислительная масс-спектрометрия, восстановление белков по спектру.
Сравнительная геномика, геномные перестройки и нахождение блоков ситнетии.
Молекулярная эволюция, алгоритмы кластеризации.
Скрытые марковские модели в биоинформатике.
Страница курса на сайте Computer science center.
Подписывайтесь на канал: https://www.lektorium.tv/ZJA
Следите за новостями:
https://vk.com/openlektorium
https://www.facebook.com/openlektorium
1. Clicking ▼&► to (un)fold the tree menu may facilitate locating what you want to find. 2. Videos embedded here do not necessarily represent my viewpoints or preferences. 3. This is just one of my several websites. Please click the category-tags below these two lines to go to each independent website.
No comments:
Post a Comment